Иллюминаторы лучше не вырезать а делать прозрачными - иначе появятся точки утечки. Смотри п 10.8 мануала.
Шпангоуты лучше сразу относить к новым слоям и печатать развертки отдельно. Слоев может быть очень много.
Каждому слою можно задавать свои свойства - массу, отключать гидростатику, видимость, цвет и т.д
Пока нельзя только создавать группы слоев - дело будущего.
Тогда назовем это "Люк в скругленной палубе".
просто как ни пытался - границы люка корежат основную геометрию..