Приказ не выносит. Кто он такой, чтобы приказывать? Он принимает решение -- с такого-то числа возлагаю на себя обязанности директора. Если нет решения, то нет и директора. А вот уже в качестве директора он имеет право и приказы издавать. А ещё зарплату получатьА если судовладелец сам себя назначил капитаном, надо ли для этого отдельный документ? Вроде как, хозяин фирмы не выпускает же приказ о назначении себя директором?
А договор (трудовой) нужен для регулирования трудовых отношений. То есть член экипажа (в том числе и капитан) это обязательно наёмный работник. Даже если он нанят самим собой.